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    JBC:大腸桿菌的Dam酶的作用機制

    發(fā)布時間: 2012-08-01  點擊次數(shù): 2531次

    加州大學(xué)圣芭芭拉分校的研究人員發(fā)現(xiàn)大腸桿菌的Dam酶在DNA上移動進(jìn)行修飾時會發(fā)生“跳躍”,并對其物理特性和行為進(jìn)行了分析,這一研究成果能為生物醫(yī)學(xué)研究和其他科學(xué)應(yīng)用提供幫助。該文章發(fā)表在Journal of Biological Chemistry雜志上。

    大腸桿菌的適應(yīng)機制使其能依據(jù)不同環(huán)境改變自己的表型(可觀察到的特性)。例如,大腸桿菌在需要尋找食物、粘附宿主組織、或者繁殖時,細(xì)菌表面會形成纖毛(毛發(fā)狀結(jié)構(gòu)),使其能夠移動、粘附或傳遞遺傳物質(zhì)。

    “我們希望了解細(xì)胞中是什么引發(fā)了這些改變,”文章*作者Adam Pollak說。

    DNA腺嘌呤甲基轉(zhuǎn)移酶Dam給DNA特定序列(GATC位點)加上甲基化標(biāo)簽,就是這種表觀遺傳學(xué)機制促使纖毛形成。類似這樣的標(biāo)簽信號機制,也在人體內(nèi)指導(dǎo)著由同樣的DNA序列形成不同器官組織的過程。這些DNA修飾標(biāo)簽的添加屬于一個廣泛的領(lǐng)域,表觀遺傳學(xué),即調(diào)節(jié)基因表達(dá)的基因組可遺傳修飾。

    此前普遍觀點認(rèn)為Dam酶只在細(xì)菌雙螺旋DNA的一條鏈上移動尋找GATC位點,但研究人員發(fā)現(xiàn),實際上Dam會在雙螺旋兩條鏈的GATC位點上“跳躍”。

    研究人員利用DpnI限制性內(nèi)切酶進(jìn)行基因工程改造,得到了甲基化位點間的長度和距離各異的多條DNA序列,并由此發(fā)現(xiàn)GATC位點的聚集會使Dam酶跳躍得更加頻繁。例如,當(dāng)兩個識別位點間距在10-200bp以內(nèi)時,Dam跳躍發(fā)生的可能性更高。GATC 位點的聚集與基因調(diào)控關(guān)系密切,而雙螺旋上單獨的GATC位點與DNA復(fù)制有關(guān)。文章還提到,Dam在DNA上移動時,未定位GATC序列的時間越長,發(fā)生跳躍的可能性越小,但GATC序列的引入會再次激活這一跳躍機制。

    文章指出,Dam酶的跳躍機制能夠解釋為何DNA修飾酶能在海量非特異性DNA中找到自己的識別位點,以及為何Dam酶能夠無視反義鏈方向而修飾多個位點。

    “舉例來說,如果我們找到一種上述開關(guān)的抑制劑,尿路感染就沒有立足之地了。”Pollak說。

    研究團隊近期還發(fā)表了一篇文章,描述了人體內(nèi)的類似機制,而這一機制在特定白血病類型中被破壞。

    該研究團隊對大腸桿菌的行為、影響毒力的因素、抗性和繁殖力進(jìn)行了數(shù)十年的研究。研究上述大腸桿菌能力的開關(guān)機制,將幫助人們了解這些能與人類共生有時又會引發(fā)疾病的細(xì)菌,并有助于相關(guān)疾病的治療。

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